巧克力囊腫在年輕女性卵巢功能正常的情況，一般不用藥是不會縮小的。有時(shí)候B超檢查到卵巢巧克力囊腫有縮小的跡象，常常是和B超檢查誤差有關(guān)，比如有時(shí)候會因?yàn)闇y量角度，或者測量手法的影響，而使得最終的結(jié)果會減小一些。如果應(yīng)用了激素類的藥物來抑制雌激素的作用，也是可以有縮小的。如同是絕經(jīng)之后，雌激素水平下降之后，也是可以有卵巢巧克力囊腫逐漸的萎縮，逐漸的消失的可能。但是，如果卵巢巧克力囊腫本身體積比較大的情況，建議盡早的做手術(shù)治療的，否則有可能會因此而發(fā)生變性，或者發(fā)生扭轉(zhuǎn)急性腹痛等情況。