人偏肺病毒q-pcr檢測方法

人偏肺病毒的q-pcr檢測主要通過核酸提取、引物探針設(shè)計(jì)、擴(kuò)增反應(yīng)、結(jié)果分析和質(zhì)控驗(yàn)證五個(gè)步驟完成。
采用磁珠法或離心柱法從呼吸道樣本中提取病毒RNA,樣本類型包括鼻咽拭子、肺泡灌洗液等。提取過程需在生物安全柜內(nèi)操作,防止氣溶膠污染,同時(shí)加入內(nèi)參基因監(jiān)控提取效率。提取后的RNA需立即逆轉(zhuǎn)錄或保存于零下80度環(huán)境。
針對(duì)病毒N基因或L基因保守區(qū)域設(shè)計(jì)特異性引物和TaqMan探針。引物長度通常為18-22個(gè)堿基,Tm值控制在58-60度,探針5'端標(biāo)記FAM熒光基團(tuán),3'端淬滅基團(tuán)多選用BHQ1。需通過BLAST驗(yàn)證序列特異性,避免與其他呼吸道病毒交叉反應(yīng)。
采用一步法RT-qPCR體系,包含逆轉(zhuǎn)錄酶、DNA聚合酶、dNTPs和緩沖液。反應(yīng)程序設(shè)置為50度逆轉(zhuǎn)錄15分鐘,95度預(yù)變性3分鐘后,進(jìn)行45個(gè)循環(huán)的95度15秒、60度1分鐘兩步擴(kuò)增。每批檢測需設(shè)置陽性對(duì)照、陰性對(duì)照和空白對(duì)照。
根據(jù)擴(kuò)增曲線Ct值判定結(jié)果,通常Ct值≤37為陽性,37-40需重復(fù)檢測,>40為陰性。采用標(biāo)準(zhǔn)品制作標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行定量分析,擴(kuò)增效率應(yīng)保持在90-110%之間。需注意曲線形態(tài)判斷,排除非特異性擴(kuò)增或抑制現(xiàn)象。
實(shí)驗(yàn)室需定期參加室間質(zhì)評(píng),每批次檢測需監(jiān)控內(nèi)參基因Ct值穩(wěn)定性。提取環(huán)節(jié)加入過程控制品,擴(kuò)增體系加入內(nèi)標(biāo)檢測抑制物。陽性樣本建議進(jìn)行基因測序驗(yàn)證,新引物探針需通過靈敏度與特異性驗(yàn)證,檢測下限需達(dá)到100拷貝/毫升。
檢測前24小時(shí)避免劇烈運(yùn)動(dòng)及高脂飲食,采樣時(shí)使用無菌聚酯纖維拭子深入鼻咽部旋轉(zhuǎn)停留10秒,采樣后2小時(shí)內(nèi)送檢。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)分區(qū)操作避免污染,定期校準(zhǔn)熒光定量PCR儀,操作人員需穿戴防護(hù)裝備。冬季流行季節(jié)可增加檢測頻次,免疫功能低下者出現(xiàn)陰性結(jié)果時(shí)建議復(fù)測或聯(lián)合血清學(xué)檢查。
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